韋皇后當政下的第二次在位
唐中宗以高官厚祿酬謝發動政變的五位首領,但朝中實權落入皇后韋氏,以及與她結為密切盟友的武則天之侄武三思手中。數月之內,韋后說服皇帝,使他相信政變首領會構成威脅。五人被封為王,因而罷去宰相之職,706年被流放,無一人倖存。
同年,中宗一位女婿王同皎被指圖謀殺害武三思並廢黜皇后,他與所謂同黨均被處死。
儲君問題
韋后不喜歡皇帝在世的長子譙王李重福,指他與自己兒子李重潤之死有關。李重潤於701年奉武則天之命被殺。李重福被遣出京城,在監視下出任地方刺史。據說中宗曾提出立其弟李旦為儲君,但李旦推辭,706年,另一子李重俊(嬪妃所生)被立為太子。
李重俊受到武三思與皇帝之女安樂公主李裹兒的羞辱,而安樂公主本人也想被立為儲君。707年,他率領一小隊人馬起事,殺死武三思及其子,但進攻宮城失敗,在逃亡途中被殺。
恩寵當政
707年以後,皇后與安樂公主主宰朝廷,另有公主之姊長寧公主、皇后之妹,以及皇帝的嬪妃上官婉兒。上官婉兒是才華出眾的詩人,負責起草詔敕。官職公然出售。任命通過「斜封」詔敕進行,繞過了中書省與門下省這兩個正常的施政渠道,官員人數膨脹,遠遠超出需要。
邊疆
708年,天山地區突厥系民族突騎施的領導權之爭牽涉到唐朝。繼承父位的娑葛,受到其父舊部屬闕啜忠節挑戰,闕啜忠節賄賂唐廷官員,支持聯合進攻娑葛。娑葛先發制人,殺死唐朝官員馮嘉賓。朝廷其後承認娑葛的地位,戰事遂告結束。
在西南方,唐中宗尋求與吐蕃帝國和平相處。710年,他派其姪李守禮(雍王)之女金城公主,嫁給吐蕃贊普赤德祖贊。